<div>Two brothers search for a Philosopher's Stone after an attempt to revive their deceased mother goes awry and leaves them in damaged physical forms.</div><div><br></div><div>แขนกล คนแปรธาตุ: บราเธอร์ฮูด
มีเนื้อเรื่องค่อนข้างอิงตามฉบับมังงะมากกว่าฉบับอนิเมะเดิม
โดยกล่าวถึงสองพี่น้องเอ็ดเวิร์ด และ อาลฟงส์ เอ็ลริค
ซึ่งถูกเลี้ยงดูโดยมารดาของเขาในหมู่บ้านรีเซมบูลในประเทศอะเมสทริส
ในขณะที่บิดาของเขา โฮเอินไฮม์ (Hohenheim)
ซึ่งเป็นนักเล่นแร่แปรธาตุที่มีพรสวรรค์มาก
ได้ละทิ้งครอบครัวไว้เบื้องหลังตั้งแต่สองพี่น้องยังแบเบาะ
ซึ่งในระหว่างที่อยู่กับแม่นั้น
ทั้งสองก็มีความฝันอยากเป็นนักเล่นแร่แปรธาตุอย่างบิดา อย่างไรก็ตาม
มารดาของทั้งสองก็เสียชีวิตจากโรคเรื้อรัง
และทั้งสองก็ตกอยู่ในการอุปการะของครอบครัวที่สนินสนม ซึ่งมีสองยายหลาน
พีนาโกะ และวินรี ร็อดเบล อาศัยอยู่<br>
<br>
ทั้งสองได้ออกเดินทางไปยังโลกกว้างกับอาจารย์สอนวิชาเล่นแร่แปรธาตุนาม
อิซุมิ เคอร์ทิส และเมื่อพวกเขากลับมายังที่บ้าน
ทั้งสองก็ตัดสินใจจะใช้วิชาเล่นแร่แปรธาตุนำมารดาที่ตายไปแล้วกลับมาแม้ว่าการแปรธาตุมนุษย์ขึ้นมาจะเป็นสิ่งต้องห้ามและถูกระบุว่าเป็นไปไม่ได้
การแปรธาตุครั้งนั้นล้มเหลวและได้ช่วงชิงร่างกายของอัลไปทั้งหมด
ในขณะที่เอ็ดก็ได้สูญเสียขาซ้ายไป และเพื่อรักษาน้องชายไว้
เอ็ดตัดสินใจสังเวยแขนขวาของตนเพื่อนำวิญญาณของอัลกลับคืนมาและตรึงวิญญาณไว้ในชุดเกราะที่อยู่ใกล้เคียง
หลังจากนั้นเอ็ดก็ได้รับออโต้เมลล์ (กายประดิษฐ์กล) จากวินรีและพีนาโกะ
สองพี่น้องเอ็ลริคตัดสินใจเผาบ้านของพวกเขาทิ้ง
เพื่อเป็นสัญลักษณ์ว่าจะไม่หวนกลับมาอีก
และมุ่งหน้าไปยังเมืองหลวงเพื่อสมัครเข้าเป็นนักเล่นแร่แปรธาตุของรัฐ
และได้รับฉายาในวงการว่า  นักเล่นแร่แปรธาตุเหล็กไหล
 และสองพี่น้องก็ได้รับ คำขอให้สืบเรื่องศิลานักปราชญ์ ซึ่งเป็นสสารในตำนาน
โดยการกำกับของพันเอก รอย มัสแตง</div>