In 2019, Kaito Yashio and Akiho Senomiya are the sole members of the Robotics Club at Central Tanegashima High School in Kyushu, Japan. Kaito is a laid back student and a skilled gamer who is just trying to help Akiho, his childhood friend. She is an energetic positive-thinking girl who yearns to complete the ongoing project of the club: building a functional replica of Gunvarrel, the main robot of a once popular TV series. As they gather new members and try to assemble the robot, Kaito starts stumbling upon secret reports that might reveal a conspiracy of large proportions. Unaware of what he is actually dealing with, Kaito little by little starts discovering clues laid by the mysterious Ko Kimijima.

ในปี ค.ศ. 2019 Divergence Ratio 1.048596 อุปกรณ์พกพา ที่เรียกว่า “PokeCom” ได้รับความนิยมมาก ซึ่งมีฟังก์ชั่นพิเศษที่ทำให้โลกเสมือนกับโลกความเป็นจริงใกล้เคียงกันมากยิ่งขึ้นในโรงเรียน จูโอทาเนะกาชิมะ
ชมรมวิจัยหุ่นยนต์กำลังจะถูกยุบ ทำให้ยาชิโอะ ไคโตะ (Yashio Kaito)เด็กหนุ่มที่ชอบเกมต่อสู้ด้วยหุ่นยนต์ และเซโนมิยะ อากิโฮะ (Senomiya Akiho) สาวที่ฝันจะสร้างหุ่นยนต์ขนาดยักษ์ ต้องพยายามกอบกู้วิกฤตนี้ วันหนึ่ง
ไคโตะได้ยินเสียงประหลาด และบังเอิญพบสัญลักษณ์ที่มองเห็นผ่าน PokeCom ในโรงเรียน สิ่งที่เขาพบผ่านฟังก์ชั่น A.R. คือ ข้อมูล Kimishima Report ในรายงานนั้นกล่าวถึงทฤษฏีสมคบคิดที่เขียนโดย คิมิชิมะ โค
โดยมีเนื้อหาเกี่ยวข้องกับความลับของโลกนี้