In an alternate universe, the Holy Grail War was won by the Yggdamillenia family. Now two factions with 7 Master-Servant pairs each and 1 extra Servant as the Ruler are fighting to win the Greater Holy Grail.
The theft of the Greater Grail from Fuyuki City leads to a splintered timeline in which the Great Holy Grail War is waged on an unprecedented scale.

เรื่องราวทั้งหมดจะเกิดขึ้นระหว่างสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ครั้งที่ 4 หรือ 10 ปีก่อนหน้าสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ใน เฟต/สเตย์ไนต์ เป็นเรื่องราวเกี่ยวกับการแย่งชิงจอกศักดิ์สิทธิ์ของเหล่าจอมเวทผู้ซึ่ง
อัญเชิญข้ารับใช้ (servant) หรือที่เรียกกันว่าวิญญาณวีรชน เข้ามาต่อสู้กัน