ในยุคที่ AI และหุ่นยนต์เข้ามามีบทบาทในชีวิตของทุกคนบนโลก เหล่าเครื่องจักรกลถูกใช้แรงงานแทนมนุษย์เพื่อความสะดวกสบาย ตัวเอกของเรื่อง “ฮิเด็น อารูโตะ” กลายมาเป็นประธานบริษัท Hiden Intelligence แบบไม่เต็มใจนัก

เมื่อมีการใช้แรงงานเหล่าหุ่นยนต์ที่ถูกเรียกว่า HumaGear แล้ว มักจะเกิดเหตุที่พวกมันออกอาละวาดอยู่บ่อยครั้ง นั่นจึงเป็นหน้าที่ของ A.I.M.S หรือหน่วยงานต่อต้าน A.I. ของรัฐบาล ที่นำโดยเจ้าหน้าที่ซึ่งใช้ระบบไรเดอร์ซิสเต็มเข้าควบคุมและต่อสู้กับ A.I. ที่ออกอาละวาดดังกล่าว

โดยเบื้องหลังของเหตุการณ์นั้นเกิดจากกลุ่มแฮคเกอร์ผู้ก่อการร้าย『เม็ทสึโบะจินไร .net』พวกมันเข้าแทรกแซงระบบ HumaGear และป้อนข้อมูลจนทำให้กลายเป็นเครื่องจักรสังหารไปในที่สุด

อารูโตะที่เป็นประธานบริษัทจึงขออาสารับผิดชอบต่อเรื่องที่เกิดขึ้นด้วยการใช้ซิสเต็มใหม่ล่าสุด Hider Zero-One Driver แปลงร่างเป็น Kamen Rider Zero-One และต่อสู้เพื่อปกป้องเหล่ามนุษย์จากองค์กรชั่วร้าย