เมื่อเหตุการณ์ลี้ลับปรากฏขึ้นและความลับดำมืดถูกเปิดเผย ความสัมพันธ์ระหว่าง ฟ็อกซ์ โมลเดอร์ (เดวิด ดูคอฟนีย์) และ ดาน่า สกัลลี่ (จิลเลี่ยน แอนเดอร์สัน) ได้ดำเนินไปในทิศทางอันเหนือคาด ในขณะที่ โมลเดอร์ ยังคงมุ่งมั่นค้นหาความจริงที่เหนือธรรมชาติ สกัลลี่ ผู้ยึดหลักเหตุผลทางวิทยาศาสตร์ก็ติดตามล่าแบบกัดไม่ปล่อยของ โมลเดอร์ อย่างไม่ลดละเช่นกัน