22 years after the disappearance of his father, Wataru Kurenai lives in an infamous "haunted house" where he is destined as Kamen Rider Kiva to fight Fangires, a species of life force-draining vampires who can assume stained glass-like monster body that his father fought years ago before his disappearance. The story is split between Wataru in the present (2008–09) and his father Otoya in the past (1986–87), slowly revealing the link between the Fangire race and Kiva.
ในปี ค.ศ. 1986 เหล่าแฟงไกอาได้ออกอาละวาดโจมตีมนุษย์ เพื่อดูดกลืนวิญญาณมนุษย์เป็นอาหารจึงทำให้เกิดองค์กร นักล่าแฟงไกอา นาม กลุ่มฟ้าสีครามสดใส เพื่อทำหน้าที่ปกป้องมนุษย์จากการอาละวาดของแฟงไกอา ในอีก 22ปี ต่อมา ปีค.ศ. 2008 แฟงไกอาในอดีต ได้เริ่มกลับมาอาละวาดซ้ำรอยอีกครั้ง ทำให้เหล่านักล่าแฟงไกอา ต้องทำหน้าที่อีกครั้งอีกครั้ง แต่ในขณะเดียวกัน ได้ปรากฏบุรุษปริศนานาม มาสค์ไรเดอร์คิบะ ผู้ปราบปรามเหล่าแฟงไกอาที่ชั่วร้าย